C# と VB.NET の質問掲示板

Style="{StaticResource DefaultWindowStyle}
にしたらどうですか？

ということは、リソースをマージできていませんね。

作成したDLLのファイル名が、Test1.dllで、
ResourceDictionary を定義している XAMLのファイル名が Test2.xaml
だとして、埋め込み先のxamlで Resourcesに以下のように定義して
みてください。
  <ResourceDictionary>
   <ResourceDictionary.MergedDictionaries>
    <ResourceDictionary Source="pack://application:,,,/Test1;component/Test2.xaml" />
   </ResourceDictionary.MergedDictionaries>
  </ResourceDictionary>

たぶん、それでうまくいくと思うのですが。

追加した上で、
  Style="{StaticResource DefaultWindowStyle}
にしても駄目ですか？
私のところでは、それでうまくいっています。

この前の話の
> <ResourceDictionary Source="pack://application:,,,/Test1;component/Test2.xaml" />
Test1の部分は、dllのファイル名ではなく、名前空間(namespace)のようです。
私の環境の場合、一致していたので勘違いしていたようです。

参考)
https://daidev1976.wordpress.com/category/c/

まず、新しいソリューションで手順を追ってみてはいかがでしょう。
Visual Studio Community 2017で以下のように

1. Visual Studioを立ち上げる

2. ファイル - 新規作成 - プロジェクトで、
　Windowsクラシックデスクトップ - WPFアプリ
　を、TestWpfAppの名前で作成する。

3. ソリューションエクスプローラのソリューションを右クリックし、
　追加 - 新しいプロジェクト　で、
　Windowsクラシックデスクトップ - WPFユーザーコントロールライブラリ
　を、StyleLibraryの名前で作成する。

4. UserControl1.xamlを削除する。

5. ソリューションエクスプローラのStyleLibraryを右クリックし、
　追加 - リソースディクショナリ　から、
　WindowBaseStyle.xamlという名前で追加する。

6. WindowBaseStyle.xamlを開き、ルート要素の下に以下のXAMLを追加する。
<Style TargetType="Window" x:Key="WindowBaseStyle">
  <Setter Property="Background" Value="Blue"/>
</Style>

7. ソリューションエクスプローラのTestWpfAppを右クリックし、
　追加 - 参照　から、
　プロジェクト - ソリューション - StyleLibrary
　にチェックを入れてOKする。

8. TestWpfAppのApplication.xamlを開き、<Application.Resources>の下に以下を追加する。
<ResourceDictionary>
  <ResourceDictionary.MergedDictionaries>
    <ResourceDictionary Source="pack://application:,,,/StyleLibrary/component;WindowBaseStyle.xaml"/>
  <ResourceDictionary.MergedDictionaries>
</ResourceDictionary>

9. MainWindow.xamlを開き、Windowの開始タグ内に以下を追加する。
Style="{StaticResource WindowBaseStyle}"

実際のコードが見えないんで、はっきりしたことが分からないんですが、
良いサンプルコードを発見したので連絡しておきます。
ここのHPにビルド可能なプロジェクトが転がっています。
  http://pro.art55.jp/?eid=1176521

[Source and Project]と書いてあるリンクからダウンロードしてください。
実際に動作するので、あかいぬさんのプロジェクトと見比べれば
何か分かるかもしれません。